Una estructura organitzativa dicta com els empleats i la gestió es comuniquen dins d'una agència. De la mateixa manera que les empreses del sector privat utilitzen les seves estructures organitzatives per aconseguir els seus objectius de productivitat i rendibilitat, les agències del sector públic utilitzen l'estructura organitzativa per dur a terme les seves tasques pel bé de tots els ciutadans. Les agències del sector públic es basen en la definició estricta de rols dins de l'estructura organitzativa per dur a terme les seves missions.
Estructura vertical
La majoria d'agències governamentals en tots els nivells utilitzen l'estructura vertical.Les estructures organitzatives verticals es defineixen tenint un cap de director o departament al capdavant, amb una sèrie de comandaments intermedis i posicions encara més baixes. Els caps de departament dicten els procediments operatius, els caps intermedis creen els plans per implementar aquests procediments, i els treballadors de nivell inferior realitzen les tasques requerides. Mentre que les diferents branques del servei militar són els principals exemples d'estructura vertical, moltes agències civils també utilitzen aquest mètode.
Estructura horitzontal
Mentre l'estructura vertical se centra en la jerarquia, l'estructura horitzontal utilitza una configuració més igual. Una estructura horitzontal utilitza menys capes entre gestió i treball i permet una comunicació més oberta entre aquestes capes. Encara que rares vegades es veu en els nivells més alts de govern, l'estructura horitzontal s'utilitza sovint en agències amb jurisdiccions més petites, pressupostos més baixos i menys empleats. Per exemple, el director d'un departament de salut local pot utilitzar una estructura horitzontal per comunicar-se directament amb inspectors i altres empleats en comptes d'utilitzar gestors intermedis.
Estructura divisòria
Les estructures divisòries separen els empleats per especialitat laboral o geografia. Cada departament supervisa les seves pròpies operacions amb un mínim d'ingrés d'altres departaments. Per exemple, a nivell federal, el Departament d'Estat s'encarrega dels afers exteriors. Dins del Departament d'Estat es troben divisions que manegen assumptes relacionats amb el creixement econòmic, els assumptes polítics, el control d'armament i els drets humans.
Estructura de matriu
Una estructura organitzativa de la matriu utilitza un sistema en el qual s'estableixen les relacions entre empleats i gestió com una quadrícula o matriu, en comptes de la jerarquia convencional. L'estructura de la matriu permet que les agències amb funcions superposades es comuniquin entre si, però també poden conduir a la duplicació d'esforços. Per exemple, la Direcció de Ciència i Tecnologia, una divisió del Departament de Seguretat Nacional, utilitza una estructura matricial per coordinar els seus esforços contra el terrorisme.
