La comptabilitat de gestió pot ser una eina eficaç per a la planificació empresarial, el desenvolupament estratègic i la supervisió interna. Al mateix temps, hi ha problemes potencials que poden sorgir basant-se exclusivament en la informació comptable de gestió. Confiar únicament en la comptabilitat de gestió pot ser perillós i conduir un negoci en la direcció equivocada. Els gestors han de ser conscients dels desavantatges de la comptabilitat de gestió per tal que puguin avaluar la informació proporcionada de manera crítica. Els administradors que poden fer-ho podran utilitzar informació de comptabilitat de gestió juntament amb altres dades per prendre decisions empresarials informades.
Falta de normalització
La comptabilitat financera és altament estandarditzada, amb comptadors financers que utilitzen directrius com Principis de comptabilitat generalment acceptats (GAAP). En contrast amb això, la comptabilitat de gestió no té un conjunt de procediments estàndard. Un comptable de gestió pot dissenyar els seus propis sistemes i mètriques per avaluar les finances d'una organització. El desavantatge d'això és que el mètode d'un comptador pot variar molt d'acord amb el mètode d'un altre. Això pot provocar inconsistències en la mesura que es mesuren els valors i les avaluacions financeres. També requereix que els comptes siguin molt més coneixedors i siguin capaços d'interpretar els sistemes comptables desenvolupats per altres.
Sobre-èmfasi en la informació quantitativa
Les dades quantitatives poden ser valuoses a l'hora de prendre decisions empresarials informades. La comptabilitat de gestió, però, se centra exclusivament en mesures quantitatius i ignora factors que no es poden mesurar en dòlars i en centaus. Per exemple, pot semblar tenir sentit econòmic reubicar una instal·lació de producció en una regió amb costos salarials més baixos. La comptabilitat de gestió pot calcular els estalvis salarials i certs augments del cost que es poden produir (per exemple, costos d'enviament o drets d'importació). La comptabilitat de gestió no pot, però, tenir en compte factors com l'estalvi relacionat amb el fons de comerç dels membres de la comunitat de la regió o els problemes de relació pública que es puguin derivar d'aquesta decisió. La comptabilitat de gestió és molt racional, però de vegades ser totalment racional pot ser un desavantatge.
Subjectivitat
La comptabilitat de gestió permet una gran subjectivitat quan es creen mètriques i mètodes per mesurar el rendiment. Això és problemàtic perquè les creences i els prejudicis personals del comptador poden tenir un impacte en la manera de mesurar el rendiment. Per exemple, si es requereix un compte de gestió per mesurar la productivitat dels treballadors, es pot centrar exclusivament en els resultats i no tenir en compte les entrades dels treballadors que poden tenir un efecte profund sobre la productivitat global. Això afecta tant a l'empresa com als empleats. L'empresa es veu afectada perquè la informació que està utilitzant pot no ser la millor i els empleats poden veure's afectats si consideren que no s'estan avaluant de manera justa.
