El procés de reciclatge del paper, tot i utilitzar menys substàncies químiques i contaminar menys de paper verge, encara afecta el medi ambient. No tot el paper reciclat és el mateix. Molt paper reciclat conté una barreja de polpa verge i reciclada per enfortir les fibres deteriorants. Com més gran sigui el contingut de polpa reciclada, menys elements químics necessitaran per al blanqueig. No totes les plantes de reciclatge utilitzen els mateixos processos i productes químics, i alguns són més perjudicials per al medi ambient que per a altres.
Surfactants
Diversos tipus de tensioactius s'utilitzen en el procés de desinfecció. Alguns són tòxics, mentre que altres són sucres o proteïnes. Els científics també desenvolupen processos mecànics i basats en enzims per a l'eliminació de tints sense químic.
Peròxid d'hidrogen
Es tracta d'un agent de blanqueig comú i ambientalment benigne que s'utilitza com a alternativa al clor.
Hidrosulfit de sodi
Això també s'utilitza habitualment per reduir els colors en la pasta de paper reciclada. Produeix el subproducte sòdic relativament benigne.
Clor
El gas clorat i els hipoclorits s'utilitzen més habitualment per a la lleixiu de polpa de paper verge, però també es pot utilitzar en paper reciclat. El clor produeix dioxines, una substància química tòxica i carcinogènica que s'endinsa en l'aire i l'aigua.
Processa clor lliure
PCF o "Process Chlorine Free" és el terme utilitzat per a paper reciclat que no utilitza clor en el seu procés de blanqueig.
